玉林CNV-seq 染色体异常检测(通用版)
适用人群
从临床决策出发,CNV-seq以1×低深度全基因组测序精准检测≥100kb染色体异常,7-10个工作日内为流产、发育迟缓等提供病因诊断。
适用人群
- 复发性流产或胚胎停育的夫妇,需明确流产组织染色体病因指导再生育决策。
- 产前超声异常或NIPT高风险的孕妇,需羊水穿刺确诊胎儿染色体非整倍体及微缺失。
- 不明原因智力发育迟缓、多发畸形的儿童,需排查全基因组微缺失/微重复综合征。
- 自闭症谱系障碍患儿,约10-15%存在可检测CNV异常,需明确遗传病因。
- 高龄孕妇(≥35岁)产前诊断,需全面评估胎儿染色体结构及数目异常风险。
- 死胎或胎儿宫内发育异常案例,需绒毛或羊水样本分析染色体病因。
检测内容
本检测采用高通量测序平台,将基因组DNA超声打断并制备文库,进行低深度(1×)全基因组测序,数据比对至GRCh37/hg19参考基因组,并经UCSC、DGV、OMIM、DECIPHER、PubMed、ISCA等国际数据库注释。覆盖范围包括全基因组层面100kb以上的拷贝数变异(CNV),可检出染色体非整倍体(如21、18、13三体及性染色体异常)以及微缺失/微重复综合征(如DiGeorge、Williams、Prader-Willi等)。对于流产组织,可明确15号染色体三体等常见流产病因(占早期自然流产1.68%)。检测不能识别多倍体、单亲二倍体、平衡易位、倒位、环状染色体、嵌合体、100kb以下缺失/重复,以及高度重复或GC含量高区域的变异。报告周期7-10个工作日,价格2100元。
检测流程
采样便捷,无需空腹。样本类型包括外周血(EDTA抗凝血≥2mL)、羊水、绒毛或流产物组织。在玉林本地可通过合作医院或采样点完成采集,支持冷链邮寄(4℃运输,24小时内送达)。DNA样本需≥1μg,流产物绒毛样本在清宫术或自然排出后立即采集最佳,避免母体污染。无需细胞培养,直接提取DNA,缩短等待时间。
准确性说明
检测基于高通量测序平台,对100kb以上CNV检出率高,变异分类参考国际标准(ACMG/ClinGen共识),结果包括致病、可能致病、临床意义未明等。阳性结果提示明确的染色体病因,如15三体导致流产;阴性结果不排除其他原因(如单基因病、母体因素)。临床意义未明变异需父母验证及结合表型综合判断。建议阳性结果通过核型或CMA复核,以确保临床决策的可靠性。
详细流程
- 临床咨询:医生评估适用场景,开具CNV-seq检测申请。
- 样本采集:在玉林医院或中心抽取外周血或采集羊水/绒毛/流产物组织。
- 样本运输:4℃冷链邮寄至实验室,24小时内送达。
- DNA提取:从样本中提取基因组DNA,质检合格后进入文库构建。
- 文库构建:超声打断DNA,制备测序文库。
- 上机测序:使用高通量测序平台进行1×低深度全基因组测序。
- 数据分析:生物信息流程比对至hg19,经多数据库注释变异,分类致病性。
- 报告出具:7-10个工作日内生成报告,由遗传咨询师解读,发送至医生或患者。
检测须知
- 检测仅针对≥100kb的CNV,不覆盖平衡易位、倒位、多倍体等结构异常。
- 结果解读可能随科学进展变化,临床意义未明变异需结合父母检测及表型。
- 样本需避免母体血液污染(尤其流产物绒毛),否则影响准确性。
- 检测不适用于体细胞突变、新生点突变及嵌合体检测。
- GC含量高或重复序列区域可能存在假阳性,数据已排除这些区域。
- 报告周期为7-10个工作日,从到样日算起,不含节假日。
- 阳性结果建议通过核型或CMA复核,以确认临床诊断。
- 检测费用2100元,不包含遗传咨询附加费用。
玉林可做此检测的机构
常见问题
Q: 我老公有平衡易位,我怀孕了,做CNV-seq能查出宝宝有没有问题吗?
A: 不能完全替代核型。CNV-seq无法检出平衡易位、倒位等结构重排。建议您做羊水穿刺后,联合核型+CNV-seq检测:核型看平衡易位,CNV-seq看100kb以上微缺失/微重复(如因易位导致的片段缺失/重复),两者互补,全面评估胎儿染色体。
Q: 我在玉林,检测报告会标注变异的具体基因吗?
A: 会的。原报告会列出变异涉及的基因名称,并提供染色体坐标、大小(Kb)、细胞遗传学条带(如15q11-q13)及变异分类(致病/可能致病/临床意义未明等)。参考数据库包括UCSC、OMIM、DECIPHER、ISCA等,确保解读有据可查。
Q: 报告中‘变异分类’是根据什么数据库判定的?
A: 依据UCSC、DGV、OMIM、DECIPHER、PubMed和ISCA等国际权威数据库。其中ISCA收录了大量临床确诊的CNV病例,是致病性判读的‘金标准’之一。解读会基于当前科学认知,未来可能随研究进展而更新。
Q: 报告显示致病性CNV,我们夫妻需要做哪些检查?
A: 建议夫妻双方先做外周血核型分析和CNV-seq验证。本检测分辨率100kb,而核型分析可看平衡易位/倒位(CNV-seq无法检测)。若夫妻一方携带相同CNV且无表型,可能为良性遗传;若为新发,则再发风险低。具体请携带报告至遗传咨询门诊,医生会综合评估是否需要进一步做全外显子测序等检查。
Q: 流产物送检后,多久能知道样本是否合格?
A: 实验室收到样本后,通常会在1-2个工作日内完成样本质量评估(包括DNA提取浓度和纯度检测)。如果样本不合格(如母体污染严重、组织量不足),客服会第一时间电话通知您,并协商补样或退费事宜。合格样本则直接进入测序流程,无需额外通知。